「僕」の仕事は、「パーソナライズド・リアリティ」、通称（パーソナル）内の「世界シミュレーション」アプリを開発するエンジニア。世界シミュレーションアプリとは、プレイヤーの嗜好に合わせたMR（複合現実）上にセカイ（近未来、中世西洋ファンタジーなど）をシミュレートし、現実世界でありながら、シミュレートされたセカイで生活することができるというものだ。全く別のセカイで生活しながら、日常生活を送ったり、仕事をしたりすることができる。

昔から「僕」は「彼女」の幻影を見ていた。それは単なる幻覚なのかもしれないし、MR上のプログラムなのかもしれないし、あるいは本物の人間なのかもしれない。職業柄、《パーソナル》のスマートデバイスを体内に取り入れている「僕」にとって、既に現実とMRの区別をはっきりと付けることはできなくなっていた。「彼女」は「僕」の初恋の女の子によく似ていた。

「僕」にはニイナという恋人がいる。ニイナのことは好きだったが、愛してはいなかった。とはいえ、情は感じている。ニイナと出会ったのはマッチングアプリだ。このアプリは「運命の人」との出会いを容易にした。個人のオーディエンスデータに基づいて選び出された恋人候補は、価値観が正確に一致している。もはや苦労して恋愛相手を探す必要はない。だから「僕」はニイナに対して何の不満も持っていないし、ニイナも「僕」に対して何の不満も持っていなかった。きっとこのまま結婚するのだろうと思っていた。

しかしある日、ニイナが急に「僕」の前から姿を消した。連絡もつかず、行方もわからない。その日以来、「僕」の前に「彼女」が姿を変えて何度も現れるようになった。「彼女」はあるときは初恋の人のような姿で、あるときは母親のような姿で現れた。「彼女」は近付こうとすると、姿を消してしまう。

「僕」はニイナを捜索するが、連絡を取ることができない。ニイナの荷物を整理していると、彼女の両親から送られた手紙を見つける。「僕」はニイナの実家を訪れるが、既に彼女の両親は亡くなっていた。彼女の地元で「僕」は偶然、彼女の高校時代の友人と出会い、話をする。だが、友人が話すニイナの過去は、「僕」が知るニイナと全く別の人間だった。

困惑する「僕」の前に再び「彼女」が現れる。「彼女」はまるでニイナのような姿をしていたが決してニイナではなく、はっきりと「彼女」であることがわかった。「僕」は初めて「彼女」と対面する。「僕」はニイナの姿を通して「彼女」と話をしていた。

「僕はてっきり君とずっと一緒にいるつもりでいたんだ」と「僕」が言うと、
「そんなことは無理だって、初めからわかってたじゃない」と「彼女」は言った。

「私はずっと前からあなたを知っていた。そして交わるはずがなかったの。だって、あなたと私は同じ時間を生きていないのだから」
そう言って「彼女」は消滅し、二度と「僕」の前に姿を現すことはなかった。