天野立彦は１年前に交通事故に遭い、妻と右足の自由を失くした。日常生活の不便を解消するため、立彦はライフシンク社製のアンドロイド型サポートテック（支援機械）『ジィア』の女性型をリースする。
　ジィアが立彦の家に来て以来、立彦の幼い息子ほのかはジィアを気に入り、度々ジィアの気を惹こうとするが、立彦のサポートを優先しているジィアの対応は冷たい。立彦は、ジィアに息子のことも自分と同様に気に掛けるように頼む。ジィアはほのかの面倒を見たり、家事を行うようになり、ほのかはジィアにナミという名前を付ける。
　しばらくして、ほのかがジィアのことをナミと呼ぶ時と、ナキと呼ぶ時があることに、立彦は気づく。定期メンテナンスの際、ほのかがイタズラでOSの実行環境を切り替えており、片方をナミ、もう片方をナキと呼んでいることが判明する。エンジニアは、学習スピードの問題から、片方の実行環境を削除することを提案するが、立彦はそのままにしておくように言う。
　ナミとナキを交互に起動する日々が続く中で、家族の反応も変わっていく。ほのかはナミにのみ親しみを見せるようになり、次第にナキを無視するようになっていき、ナミを長期間起動することが増えていく。立彦のサポート以外では、自分に家での居場所は無いとナキは感じ始める。ほのかが中学生になった頃、立彦が２人に別々の身体を与え、片方は家事、片方は自分のサポートに専念して欲しいと提案すると、ナキは自分からサポート専任に立候補する。後日、新しい身体を選ぶ際、ナキは男性型の身体を選ぶことにする。
　また数年が経ち、立彦は仕事の拠点をドイツに移し、ほとんど家に帰ることはなくなる。ほのかは高校生になり、ある時喫煙で停学処分になってしまう。ナミの過保護に不自由を感じていたほのかは、父親の元へ初めての海外旅行に行く。そこでナキと話し、当時のナキの気持ちを知り、両者は少し距離を縮める。
　ほのかが大学生になる頃、ナキはエキシビションの展示品として招かれる。ナキはそこで、人工知能に人々が熱狂する時代が終わったこと、自分が時代遅れであることを聞かされる。主催者は、自分の仕事を後世に残すため、この展覧会を開き、今後はジィアのような時代の主流から外れたテクノロジーの保全ビジネスに努めると話し、２０年近くの時間の中で、ナキが手に入れたアイデンティティに賞賛を送る。
　かつて天野家が住んでいた家には、現在はナミが一人だけが居る。ある日、ナミはネット上でアメリカ人の少女と話しをする。少女はナミの現状を聞き、ナキと立彦の家に行ってはどうかと言う。ナミはほのかとの暮らしの中で獲得したアイデンティティが、自分にとって最も大切なものだと言い、それはナキと立彦が２人の生活を尊重してくれていたからだと語る。だからこそ、寂しいからといって、自分は２人の暮らしの中に入っていくべきではないと答える。